การตั้งค่า SEO ของ Joomla! เป็นการต้องค่าของ SEF URLs  หรือ Search Engine Friendly URLs ซึ่งมีประโยชน์ต่อ search engine มาก เพราะ search engine ไม่ค่อยชอบ url ที่มี query string ยาวๆ

การตั้งค่าเป็นการเปลี่ยน url ในรูปแบบที่ดูน่า งง งวย อันเกิดจาก ภาษาสำหรับเขียนเว็บอย่างใน Joomla เขียนด้วย  php  ให้อยู่ในรูปแบบที่ เรียบง่าย เช่น เป็น url ของไฟล์ html ธรรมดา เพื่อให้เว็บดูปลอดภัย สำหรับผู้ใช้ และ มีความเป็น search engine friendly หรือ ช่วยให้ง่ายต่อการ ค้นหา ข้อมูล ของ search engine

นอกจากนั้น เป็นเรื่องของความปลอดภัยด้วย เพราะ Hacker ค้นหาเว็บเป้าหมายจาก URLs ถ้าเราเปลี่ยน ให้เป็น SEF URLs ก็จะหาไม่เจอนั้นเอง